Однокапиллярный генетический анализатор на основе капиллярного электрофореза НАНОФОР^® 05 предназначен для автоматического определения последовательности ДНК и для проведения фрагментного анализа ДНК.

НАНОФОР^® 05 — это высокопроизводительный прибор, способный работать автоматически в круглосуточном режиме.

НАНОФОР^® 05 является прибором генетического анализа на основе капиллярного электрофореза с четырехцветной лазериндуцированной флуоресцентной детекцией.

Проба – смесь фрагментов ДНК, отличающихся на одно звено, или фрагменты ДНК, полученные методом ПЦР в реальном времени, с помощью автоматизированного устройства позиционирования, электрокинетически вводится в капилляр, заполненный раствором геля.

В ходе электрофореза фрагменты ДНК разной длины эффективно разделяются с разрешением в один нуклеотид. При прохождении через окно детектора происходит возбуждение флуорофора, связанного с молекулой ДНК. Сигнал флуоресценции детектируется в одном из четырех каналов. В случае сиквенсных смесей каждый из четырех цветов флуоресценции строго соответствует своему нуклеотиду, а последовательность выхода цветных пиков соответствует последовательности анализируемой ДНК.
 

Медицина, санитарно-эпидемиологический контроль, сельское хозяйство, криминалистика, биотехнология, фундаментальные исследования в области анализа нуклеиновых кислот.

Разделение тестовой смеси 5` FAM-меченных политимидиатов длиной 5, 15, 25, 35, 45, 55, 65, 75, 85, 95, 100, 101 нуклеотидов	Разделение тестовой смеси 5` FAM-меченных ПЦР фрагментов длиной 100, 200, 300, 400, 500, 600 нуклеотидов

Фрагмент последовательности ДНК плазмиды pGEM3Zf(+)

Прибор позволяет:

•  автоматически заполнять капилляр раствором разделяющего полимера;

•  электрокинетически вводить пробу в капилляр из заданной позиции 96-луночного планшета;

•  проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК при контролируемых значениях силы тока, напряжения и температуры;

•  детектировать сигнал флуоресценции в четырех каналах 520, 550, 580 и 607 нм;

•  проанализировать до 96 образцов без помощи оператора по заданной программе.

Программное обеспечение рассчитано на работу в среде Windows NT , 95/98, 2000, XP и состоит из двух блоков: блок фрагментного анализа и блок анализа нуклеотидной последовательности.

Программное обеспечение позволяет:

•  задавать параметры эксперимента;

•  визуально контролировать основные параметры в ходе электрофореза;

•  проводить анализ полученных данных в ручном и автоматическом режимах;

•  иметь доступ к необработанным данным.

Специально для прибора разработаны следующие реактивы:

•  разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования;

•  наборы для секвенирования со стандартными (М13, T 7) праймерами;

•  маркеры молекулярного веса ДНК.

В стадии разработки находится набор для секвенирования с флуоресцентно-меченными терминаторами.

Прибор не имеет отечественных аналогов.

По своим возможностям прибор не уступает лучшим зарубежным аналогам (ABI Prizm 310 Applied Biosystems, США) при значительно меньшей цене.
 

Ведется подготовка к сертификации прибора.
Получен патент РФ на изобретение № 2182329 "Флуориметрический детектор" от 10 мая 2002 г.
 

Институт аналитического приборостроения РАН - разработка и изготовление НАНОФОР 05;

ЗАО "Синтол" — разработка специальных реактивов: разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования; наборы для секвенирования со стандартными (М13, T 7) праймерами; маркеры молекулярного веса ДНК.