Назначение
Генетический анализатор НАНОФОР® 05 предназначен для автоматического определения последовательности ДНК и для проведения фрагментного анализа ДНК. НАНОФОР® 05 — это высокопроизводительный прибор, способный работать в автоматическом режиме 24 часа в сутки.

Краткое описание, используемый метод

НАНОФОР^® 05 является прибором восьмикапиллярного электрофореза с пятицветной лазериндуцированной флуоресцентной детекцией. Проба — смесь фрагментов ДНК, отличающихся на одно звено, или фрагменты ДНК, полученные методом ПЦР в реальном времени, с помощью автоматизированного устройства позиционирования электрокинетически вводится в капилляр, заполненный раствором геля.

В ходе электрофореза фрагменты ДНК разной длины эффективно разделяются с разрешением в один нуклеотид. При прохождении через окно детектора происходит возбуждение флуорофора, связанного с молекулой ДНК. Сигнал флуоресценции детектируется в одном из пяти каналов. В случае сиквенсных смесей каждый из пяти цветов флуоресценции строго соответствует своему нуклеотиду, а последовательность выхода цветных пиков соответствует последовательности анализируемой ДНК.

 

Основные технические характеристики

Детектор	Флуориметрический детектор на длины волн 520, 550, 580, 610 и 650 нм
Лазер	Твердотельный, λ = 488 нм, мощность Р = 1–20 мВт
Разрешение	Разрешение одноцепочечных фрагментов ДНК с шагом в один нуклеотид в диапазоне длин до 700 нуклеотидов (достоверность результата > 98%)
Время одного анализа, ч.	не более 1.5
Источник высокого напряжения	Напряжение 20 кВ, ток 1–250  мкА, нестабильность не более 0.03 %
Ввод пробы	Электрокинетический
Магазин проб и вспомогательных растворов	96-ячеечный планшет для проб, 12 пробирок
Капилляр	Кварцевый, внутренний диаметр 30–80 мкм, наружный диаметр 360 мкм, длина до 630 мм
Термостатирование и контроль температуры	Термостат с элементами Пелтье; поддержание температуры капилляра в диапазоне 30–60 (±0.2) °С
Режим работы	Автоматическое перезаполнение геля. Автоматическое разделения пробы по заданной программе с непрерывным контролем процесса и параметров эксперимента
Потребляемая мощность, кВт	0.3
Масса, кг	60
Габариты, мм	690x630x600

Области применения, примеры

Медицина, санитарно-эпидемиологический контроль, сельское хозяйство, криминалистика, биотехнология, фундаментальные исследования в области анализа нуклеиновых кислот.

 

Фрагмент последовательности ДНК плазмиды pGEM3ZF(+)

Особенности, сравнение с аналогами

Прибор позволяет:

•  автоматически заполнять капилляр раствором разделяющего полимера;

•  электрокинетически вводить пробу в капилляр из заданной позиции 96-луночного планшета;

•  проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК при контролируемых значениях силы тока, напряжения и температуры;

•  детектировать сигнал флуоресценции в пяти каналах 520, 550, 580, 610 и 650 нм;

•  проанализировать до 96 образцов без помощи оператора по заданной программе.

Программное обеспечение рассчитано на работу в среде Windows XP и состоит из двух блоков: блок фрагментного анализа и блок анализа нуклеотидной последовательности.

Программное обеспечение позволяет:

•  задавать параметры эксперимента;

•  визуально контролировать основные параметры в ходе электрофореза;

•  проводить анализ полученных данных в ручном и автоматическом режимах;

•  иметь доступ к необработанным данным.

Специально для прибора разработаны следующие реактивы:

•  разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования;

•  наборы для секвенирования со стандартными (М13, T7) праймерами;

•  маркеры молекулярного веса ДНК;

•  набор для секвенирования с флуоресцентно-меченными терминаторами.

Прибор не имеет отечественных аналогов. По своим возможностям прибор не уступает лучшим зарубежным аналогам (ABI Prizm 310 Applied Biosystems, США) при значительно меньшей цене.
 

Правовая защита

Патент РФ на изобретение № 2182329 «Флуориметрический детектор» от 10 мая 2002 г.

Патент на полезную модель № 132203 «Многоканальный капиллярный генетический анализатор» от 11 октября 2012г.

Изготовитель

Институт аналитического приборостроения РАН - разработка и изготовление НАНОФОР^® 05;

ЗАО «Синтол» www.syntol.ru — разработка специальных реактивов: разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования; наборы для секвенирования со стандартными (М13, T7) праймерами; маркеры молекулярного веса ДНК.

 
Лаборатория методов и приборов иммунного и генетического анализа>>