Каталог приборов

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗАТОР
НАНОФОР® 05

Однокапиллярный генетический анализатор на основе капиллярного электрофореза НАНОФОР® 05 предназначен для автоматического определения последовательности ДНК и для проведения фрагментного анализа ДНК.

НАНОФОР® 05 — это высокопроизводительный прибор, способный работать автоматически в круглосуточном режиме.

 

 

Краткое описание, используемый метод, функциональная схема

НАНОФОР® 05 является прибором генетического анализа на основе капиллярного электрофореза с четырехцветной лазериндуцированной флуоресцентной детекцией.

Проба – смесь фрагментов ДНК, отличающихся на одно звено, или фрагменты ДНК, полученные методом ПЦР в реальном времени, с помощью автоматизированного устройства позиционирования, электрокинетически вводится в капилляр, заполненный раствором геля.

Подпись:

 

В ходе электрофореза фрагменты ДНК разной длины эффективно разделяются с разрешением в один нуклеотид. При прохождении через окно детектора происходит возбуждение флуорофора, связанного с молекулой ДНК. Сигнал флуоресценции детектируется в одном из четырех каналов. В случае сиквенсных смесей каждый из четырех цветов флуоресценции строго соответствует своему нуклеотиду, а последовательность выхода цветных пиков соответствует последовательности анализируемой ДНК.
 

Основные технические характеристики

Детектор

Флуориметрический детектор на длины волн
520, 550, 580 и 607 нм

Лазер

Твердотельный, λ = 473 нм, мощность Р = 1-10 мВт

Разрешение

Разрешение одноцепочечных фрагментов ДНК с шагом в один нуклеотид в диапазоне длин до 600 нуклеотидов (достоверность результата > 98%)

Время анализа, ч, не более

2.5

Источник высокого напряжения

Напряжение 15 кВ, ток 1–150 мкА,
нестабильность не более 0.03 %

Ввод пробы

Электрокинетический

Магазин проб и вспомогательных растворов

96-ячеечный планшет для проб, 12 пробирок для вспомогательных растворов объемом от 0.5 до 3 мл

Капилляр

Кварцевый, внутренний диаметр 30–80 мкм,
наружный диаметр 360 мкм, длина до 1000 мм

Термостатирование и контроль температуры

Термостат с элементами Пелтье; поддержание температуры
капилляра в диапазоне 15–65 (±0.2) °С

Режим работы

Автоматическое перезаполнение геля под давлением до 10 атм. Автоматическое разделения пробы по заданной программе с непрерывным контролем процесса и параметров эксперимента

Потребляемая мощность, кВт

0.3

Масса, кг

75

Габариты, мм

850x750x600




Области применения, примеры

Медицина, санитарно-эпидемиологический контроль, сельское хозяйство, криминалистика, биотехнология, фундаментальные исследования в области анализа нуклеиновых кислот.

Разделение тестовой смеси 5` FAM-меченных политимидиатов длиной 5, 15, 25, 35, 45, 55, 65, 75, 85, 95, 100, 101 нуклеотидов

Разделение тестовой смеси 5` FAM-меченных ПЦР фрагментов длиной 100, 200, 300, 400, 500, 600 нуклеотидов

 

Фрагмент последовательности ДНК плазмиды pGEM3Zf(+)


Особенности, сравнение с аналогами

Прибор позволяет:

•  автоматически заполнять капилляр раствором разделяющего полимера;

•  электрокинетически вводить пробу в капилляр из заданной позиции 96-луночного планшета;

•  проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК при контролируемых значениях силы тока, напряжения и температуры;

•  детектировать сигнал флуоресценции в четырех каналах 520, 550, 580 и 607 нм;

•  проанализировать до 96 образцов без помощи оператора по заданной программе.

Программное обеспечение рассчитано на работу в среде Windows NT , 95/98, 2000, XP и состоит из двух блоков: блок фрагментного анализа и блок анализа нуклеотидной последовательности.

Программное обеспечение позволяет:

•  задавать параметры эксперимента;

•  визуально контролировать основные параметры в ходе электрофореза;

•  проводить анализ полученных данных в ручном и автоматическом режимах;

•  иметь доступ к необработанным данным.

Специально для прибора разработаны следующие реактивы:

•  разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования;

•  наборы для секвенирования со стандартными (М13, T 7) праймерами;

•  маркеры молекулярного веса ДНК.

В стадии разработки находится набор для секвенирования с флуоресцентно-меченными терминаторами.

Прибор не имеет отечественных аналогов.

По своим возможностям прибор не уступает лучшим зарубежным аналогам (ABI Prizm 310 Applied Biosystems, США) при значительно меньшей цене.
 

Сертификация, правовая защита

Ведется подготовка к сертификации прибора.
Получен патент РФ на изобретение № 2182329 "Флуориметрический детектор" от 10 мая 2002 г.
 

Изготовитель

Институт аналитического приборостроения РАН - разработка и изготовление НАНОФОР 05;

ЗАО "Синтол" — разработка специальных реактивов: разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования; наборы для секвенирования со стандартными (М13, T 7) праймерами; маркеры молекулярного веса ДНК.

ИАП РАН, Рижский пр., 26., Санкт-Петербург, 190103
тел.: (812) 3630719, факс: (812) 3630720, mail: iap@ianin.spb.su